Участниками проекта могут быть только юридические лица, созданные в соответствии с законодательством Российской Федерации, при одновременном соблюдении следующих условий:

- постоянно действующий исполнительный орган юридического лица (генеральный директор и т.п.), иные органы или лица, имеющие право действовать от имени юридического лица без доверенности, постоянно находятся на территории ИНТЦ;
- учредительные документы юридического лица предусматривают осуществление им научно-технологической деятельности в соответствии с Законом № 216-ФЗ.

Фонд, управляющая компания, ее дочерние общества не вправе выступать учредителями участников проекта.

Право на осуществление научно-технологической деятельности на территории ИНТЦ возникает у юридического лица со дня принятия управляющей компанией решения о предоставлении ему статуса участника проекта.

Лицо, не соответствующее перечисленным выше условиям, вправе осуществлять научно-технологическую деятельность на территории ИНТЦ без получения статуса участника проекта на основании соглашения с управляющей компанией. После заключения такого соглашения лицо включается в реестр лиц, участвующих в реализации проекта, однако на него не распространяются льготы, предусмотренные для участников проекта.

Инициатор проекта вправе осуществлять на территории ИНТЦ научно-технологическую деятельность без получения статуса участника проекта и при этом также включается в реестр лиц, участвующих в реализации проекта.

Начиная с 15 июня 2018 года участник проекта может одновременно являться участником проекта в рамках инновационного центра "Сколково" в соответствии с Федеральным законом от 28 сентября 2010 г. № 244-ФЗ и участником других проектов ИНТЦ при условии соблюдения им требований к участникам проекта и условий, установленных Законом № 216-ФЗ, за исключением условия о постоянном нахождении на территории ИНТЦ генерального директора.